博客文章:

最大化连接性:采用 SDMS 的复杂仪器

最大化连接性:采用 SDMS 的复杂仪器LIMS 的全部目的(或至少是主要目的)是能够将其作为“所有实验室”的中央存储库。然而,LIMS 作为实验室信息化中心的能力取决于它与其他仪器和系统的通信能力。

实验室经理可能希望将许多不同类型的仪器连接到 LIMS,这些仪器被归类为“简单仪器”或“复杂仪器”。

简单仪器与复杂仪器
有什么区别?

“简单”仪器被定义为使用 RS-232 等协议的仪器。这些仪器:

  • 在不知道样品 ID 的情况下生成原始测试结果
  • 同步接收命令
  • (可选)发回响应。

此类仪器的示例包括重量天平或 pH 计。

连接简单的仪器应该很简单

LabVantage 拥有开箱即用的完整解决方案,用于连接简单的仪器,该功能不需要特殊许可证或软件。

另一方面,复杂的仪器通常会返回多个结果 — 可能针对多个样品。它们也可能是双向接口,以接收工作列表。与复杂仪器的通信可以通过文件或网络接口 (TCP/IP) 进行。示例包括色谱系统,以及驱动这些仪器的软件解决方案(例如,Thermo Chromeleon 或 Agilent OpenLab)。

LabVantage SDMS 系统
LabVantage 通过我们的 SDMS 简化了复杂实验室工具的集成。该模块提供强大的读/写/发送/接收和数据转换功能,让您利用实验室仪器的强大功能。

SDMS 驱动程序基于强大的 Talend Open Studio ETL 程序,通过文件或 TCP/IP 与复杂的仪器连接,以向 LIMS 发送和接收数据。该模块使用 ETL 提取、转换和加载),这是用于处理可能既复杂又庞大数据的软件的行业标准首字母缩写。

虽然仪器结果通常不被视为大数据,但 ETL 软件具有处理可能非常大的仪器数据集所需的能力和吞吐量。

一旦模块被激活,SDMS 就是 LabVantage 平台的一个组成部分,并在应用程序中显示为用于配置和数据管理的普通网页。此外,还可以将其他 SDMS 收集器(一种从实验室源收集数据的功能)安装在运行实验室仪器软件的其他服务器或计算机上。

确保您具有强大的审计跟踪能力
对于写入文件的仪器和软件,SDMS 收集器可以访问远程文件系统,以读取和写入仪器文件与日志。

许多实验室经理对审计跟踪、通知和日志这一现在至关重要的问题感到担忧。LabVantage SDMS 通过多种方式解决了这个问题,确保您的实验室符合最高的数据完整性标准

工作原理:

  • 当 LabVantage SDMS 直接通过网络接收数据或检测到新的仪器文件被写入时,它会快速拾取文件,解析数据,并将这些结果直接导入 LabVantage,提供完整的审计跟踪。
  • 成功将结果发布到 LIMS 后,SDMS 会自动将所有原始数据文件打包、加密并放入附件存储库中,该存储库已在解析之前完成了对输入数据和原始数据的审计跟踪。
  • 如果事务失败,用户将收到通知,以便可以重新处理原始数据。
  • SDMS 将成功和失败事务的原始数据与日志文件保留在附件存储库中,以便实验室可以保留这些数据和日志文件,以备将来审计和确保可追溯性。

 用于仪器接口的 LIMS D.I.Y. 仪器驱动器
我们的年度 CTEC 会议不仅对我们的客户,而且对我们来说都是一个很好的学习机会。我们对 LabVantage LIMS 所做的一些升级和平台更改直接源自用户的建议。

其中一项功能是自助式仪器驱动程序,长期以来,客户一直要求能够创建和修改自己的驱动程序,而不是为客户安装编写代码来解析复杂的仪器数据。SDMS 使客户能够自助服务,甚至是创建和修改复杂的驱动程序!

由于 Talend Open Studio 是一个开源 ETL 工具,因此任何了解该工具的人都可以创建 SDMS 驱动程序。Open Studio 具有 200 多个用于接收、转换和加载数据的拖放组件,是解析和发布仪器数据的最佳环境。

在 LIMS 上创建和部署仪器驱动程序非常困难。有些更容易开发,而另一些则不然。

驱动程序可以像读取、映射和发布数据一样简单。另一方面,它们可能涉及大量的数据操作和对 LIMS 执行查询,以在发布数据之前收集补充数据。

复杂的仪器数据很难归一化和转换,以将其用于 LIMS。虽然相比于今天,这在历史上是更为真实的问题,但这种集成仍然很棘手。Open Studio 图形界面的使用大大简化了这项任务。

无缝的仪器接口

LIMS 复杂仪器驱动接口

虽然开发人员和 IT 团队希望能够灵活地开发最复杂的驱动程序,但大多数用户只想要无缝体验。在设计 SDMS 时就考虑到了可用性和可访问性,特别是对于双向仪器。

开发了驱动程序后,可以快速导出并上传到 LabVantage LIMS,以供 SDMS 使用。驱动程序工作流程很简单:

  • 用户将工作清单发送到仪器。
  • 仪器的软件加载工作列表并执行。
  • 然后将数据直接返回到 LabVantage LIMS。

无论您是想创建自己的 LIMS 仪器驱动程序,还是想让 LabVantage 专业服务为您创建,SDMS 都能将任何仪器或软件连接到您的 LabVantage 系统。